Publié le 15 septembre 2025

Blog Kirill Lotonin – Peste porcine africaine

« Pour développer un vaccin sûr et efficace contre le virus de la peste porcine africaine, il est essentiel de réaliser une analyse complète des réponses immunitaires protectrices et préjudiciables au virus. »

Clarifier une situation complexe : explorer l’immunité contre le virus de la peste porcine africaine pour arriver à développer un vaccin

Le virus de la peste porcine africaine (VPPA), qui affecte les porcs domestiques et les sangliers, est une maladie hémorragique grave qui menace la santé animale, le bien-être des animaux et l’économie dans les régions touchées. Le virion du virus de la PPA est complexe et possède plusieurs couches. Les antigènes de ce virion n’ont pas été entièrement caractérisés et il utilise diverses stratégies pour moduler la réponse immunitaire de son hôte. De plus, les mécanismes qui sous-tendent la protection immunitaire sont mal connus. Tous ces facteurs entravent la mise au point de vaccins sûrs et efficaces.

Entretien avec le Dr Kirill Lotonin

• Quel était l’objectif de votre thèse ?

  Ma thèse portait sur la caractérisation des réponses immunitaires adaptatives après une infection par le VPPA. Elle s’articule en deux parties. Le premier objectif était de définir un cadre pour évaluer l’efficacité des candidats vaccins vivants atténués contre le virus de la PPA. Pour ce faire, nous avons corrélé divers paramètres immunologiques avec les résultats cliniques de l’infection provoquée chez des porcs immunisés. Le second objectif était de caractériser la diversité des antigènes viraux des lymphocytes B afin de développer un vaccin à sous-unités plus sûr contre le VPPA.

• Quels sont les principaux résultats de votre thèse ?

  Pour atteindre le premier objectif, nous avons comparé des porcs exempts de pathogènes spécifiques et des porcs d’élevage en utilisant un modèle précédemment établi : leur un statut immunologique est différent, ils ne sont pas détenus dans des conditions d’hygiène équivalentes et ne montrent pas la même résistance au virus. Les deux groupes ont été immunisés avec la souche atténuée du VPPA « Estonia 2014 ». Une fois le virus éliminé, les porcs ont été exposés à la souche hautement virulente « Armenia 2008 ». Cette étude de suivi a consisté à analyser les réponses immunitaires innées et adaptatives des porcs sur le long terme afin de déterminer les corrélats de protection (CoP). Nous avons notamment identifié les CoP suivants : réponse précoce et soutenue à l’interféron alpha, activation des voies de présentation de l’antigène, contrôle des niveaux d’IL-8 pendant l’immunisation et forte induction de lymphocytes T à mémoire et de lymphocytes T cytotoxiques après l’exposition.
  
  Pour atteindre le second objectif, nous avons collaboré avec une société de biotechnologie qui a mis au point un microarray à l’échelle du protéome pour rechercher, dans les sérums immunitaires, les anticorps qui s’assemblent aux protéines du VPPA. Cette approche nous a permis d’identifier de nouveaux antigènes de lymphocytes B, dont certains ont été utilisés pour créer des candidats vaccins à particules pseudovirales. Ces antigènes se sont révélés immunogènes chez les souris et les porcs, mais la réponse des anticorps aux antigènes n’a pas suffi pour conférer une protection contre la souche virulente du VPPA.

  

  Modèle de réponses immunitaires protectrices contre le VPPA chez les porcs immunisés. — © Created in BioRender. Lotonin, K.

• En quoi vos résultats vont-ils contribuer à faire avancer la recherche ?

  Actuellement, les vaccins vivants atténués représentent la stratégie la plus prometteuse pour lutter contre la PPA, leur administration s’étant révélée efficace à 100 % dans de nombreuses études. Néanmoins, ils ne peuvent pas encore être utilisés à grande échelle car ils ne sont pas totalement sûrs et risquent de provoquer un retour à la virulence et des complications potentielles chez les hôtes immunodéprimés. De plus, les mécanismes sous-jacents à la protection et à la pathogenèse après la vaccination ne sont pas encore totalement compris. Les CoP identifiés permettront de concevoir des vaccins de façon plus rationnelle et faciliteront l’évaluation des nouveaux candidats vaccins. En parallèle, nous avons contribué aux efforts déployés pour mettre au point un vaccin à sous-unités contre le VPPA présentant un meilleur profil d’innocuité. Les antigènes identifiés peuvent également être testés sous une forme plus immunogène, induisant idéalement des réponses immunitaires à la fois humorales et cellulaires.

• De quoi êtes-vous le plus fier dans ce travail ?

  Lorsque j’ai commencé à travailler à l’IVI en 2020, le VPPA n’était pas un sujet d’actualité, car le SARS-CoV-2 accaparait alors l’attention du monde entier. Cinq ans plus tard, je trouve incroyable de voir comment la recherche sur le virus de la PPA a évolué en Europe et ailleurs dans le monde. Je me sens à la fois fier et chanceux d’avoir contribué à ces avancées. Je suis convaincu que les données obtenues à l’IVI auront un impact significatif. De plus, mon travail à l’IVI m’a fait avancer tant au niveau personnel que professionnel. Les nombreuses compétences que j’ai acquises m’ont permis d’aborder des questions scientifiques très diverses.

• Qu’avez-vous particulièrement apprécié au cours de votre thèse ?

  À l’IVI, la recherche sur le VPPA est un véritable travail d’équipe. Elle réunit des experts en immunologie systémique et moléculaire, en virologie et en sciences vétérinaires. J’ai été conseillé et soutenu, et j’ai vraiment apprécié le degré élevé de confiance et de liberté qui m’a été accordé pour mener à bien mon projet.

• Comment avez-vous vécu le temps passé au sein de l’IVI ?

  Dans le laboratoire, il y a peu d’espace et l’on peut se sentir isolé du monde extérieur, mais j’y ai rencontré des gens formidables. J’ai noué des liens étroits avec mes collègues, et ces relations m’ont vraiment aidé à relever les défis auxquels j’ai été confronté pendant ma thèse.

• Quels sont vos projets maintenant ? Qu’allez-vous faire ?

  J’ai récemment soutenu ma thèse et, pour l’instant, je rattrape le temps passé à écrire en ayant profité de l’été à Berne, le plus souvent dans la nature. Je cherche aussi un nouveau poste de recherche en Europe : je souhaite étudier la réponse immunitaire à un nouveau groupe de pathogènes.

Publication (eLife):
Correlates of protection against African swine fever virus identified by a systems immunology approach

Auteurs
Kirill Lotonin, Francisco Brito, Kemal Mehinagic, Obdulio García-Nicolás, Matthias Liniger, Noelle Donzé, Sylvie Python, Stephanie Talker,Tosca Ploegaert, Nicolas Ruggli, Charaf Benarafa, Artur Summerfield

Information sur la peste porcine africaine
Étude comparative de l'immunité contre la peste porcine africaine chez les porcs conventionnels de ferme et les porcs SPF de l'IVI
Peste porcine africaine : un virus complexe qui soulève de nombreuses questions