Die Dienstleistungen am Standort Bern umfassen die Diagnostik ausgewählter Viruserkrankungen der Rinder, Pferde und kleinen Wiederkäuer. Aufgrund einer Koordination innerhalb der Schweiz betrifft dies schwerpunktmässig vor allem Infektionen mit Pestiviren und Lentiviren sowie Viruskrankheiten der Pferde. Das am Institut angesiedelte nationale Referenzzentrum für die Tollwut (Schweizerische Tollwutzentrale) ist zuständig für die Diagnostik der Tollwut und für die Tollwutserologie im Human- und Veterinärbereich.